Bacteriën hebben een goed gedefinieerd genoom, dat is de complete set DNA-moleculen die de genetische informatie van het organisme dragen. Bacteriën bezitten geen verborgen genen buiten hun genoom. Bacteriën kunnen echter nieuwe genen verwerven via horizontale genoverdracht, waarbij genen worden overgedragen tussen verschillende organismen, bijvoorbeeld door de opname van vreemd DNA of virussen.