Science >> Wetenschap >  >> Biologie

Geavanceerde celatlas opent nieuwe deuren in biomedisch onderzoek

Een multi-omics gezonde menselijke eencellige atlas. Credit:Genoombiologie (2024). DOI:10.1186/s13059-024-03246-2

Onderzoekers van het Karolinska Institutet hebben een webgebaseerd platform ontwikkeld dat een ongekend beeld biedt van het menselijk lichaam op cellulair niveau. Het doel is om een ​​onschatbare hulpbron te creëren voor onderzoekers over de hele wereld om de kennis over de menselijke gezondheid en ziekte te vergroten. Het onderzoek is gepubliceerd in Genome Biology .



Gelijktijdige meting van talrijke biomoleculaire variabelen, bekend als multi-omics, maakt een diepgaande en uitgebreide profilering van de menselijke biologie mogelijk. De nieuwe Single Cell Atlas (SCA) is gebaseerd op analyses van duizenden menselijke weefselmonsters uit 125 verschillende volwassen en foetale weefsels. De onderzoekers combineerden acht geavanceerde omics-technologieën, waaronder single-cell RNA-sequencing, hele genoomsequencing en ruimtelijke transcriptomics om genen die in het weefsel tot expressie komen in kaart te brengen en te lokaliseren.

De weg vrijmaken voor nieuwe ontdekkingen

Het platform biedt unieke inzichten in individuele celeigenschappen en hun interacties binnen weefsels. De uitgebreide verzameling gegevens is vrij toegankelijk via de website van het platform.

"De Single Cell Atlas bespaart niet alleen tijd en middelen, maar bevordert ook een samenwerkingsomgeving voor wetenschappers uit diverse vakgebieden, waardoor de weg wordt vrijgemaakt voor nieuwe ontdekkingen en innovaties", zegt Lu Pan, onderzoeker aan het Institute of Environmental Medicine, Karolinska Institutet, en de eerste auteur van het onderzoek.

Credit:Single Cell Atlas

Vooruitkijkend is het team van plan de SCA te verfijnen door meer gedetailleerde analyses en jaarlijkse updates te introduceren. Deze verbeteringen zullen hiaten in de weefselrepresentatie opvullen en de steekproefomvang vergroten, waardoor nauwkeuriger onderzoek mogelijk wordt.

"De oprichting van de SCA betekent een belangrijke stap voorwaarts in het biomedisch onderzoek", zegt Xuexin Li, onderzoeker bij de afdeling Fysiologie en Farmacologie (voorheen bij de afdeling Medische Biochemie en Biofysica), Karolinska Institutet. "Ons doel is om de atlas voortdurend te verrijken, waardoor deze een onschatbare bron wordt voor het begrijpen van de menselijke gezondheid en ziekte."

Meer informatie: Lu Pan et al., Single Cell Atlas:een eencellige multi-omics encyclopedie voor menselijke cellen, Genoombiologie (2024). DOI:10.1186/s13059-024-03246-2

Journaalinformatie: Genoombiologie

Aangeboden door Karolinska Institutet