De milieukwesties van Cambodja vallen uiteen in twee hoofdcategorieën: het beheer of wanbeheer van natuurlijke hulpbronnen en problemen met vervuiling en sanitaire voorzieningen in de groeiende stedelijke gebieden.

Ontbossing

Cambodja heeft het op twee na hoogste percentage van ontbossing in de wereld, gemotiveerd door houtoogst en kaalslag voor de landbouw. Ontbossing vernietigt habitats en verstoort de balans van delicate tropische bodems. Zonder bomen die de grond op hun plaats houden en organisch materiaal aanvullen met bladafval, erodeert de bodem snel en verliest veel van zijn vruchtbaarheid in de eerste paar jaren van de teelt.

Kustproblemen

Cambodja's ecosystemen langs de kust , waarvan er veel mangrovebossen zijn die belangrijke paaigronden voor vissen en bescherming tegen overstromingen bieden, worden door verschillende factoren bedreigd. Kustecosystemen worden verstikt door uitgespoelde sedimenten van recent ontboste gebieden in het binnenland. Deze wateren bevatten ook gevaarlijke pesticiden en meststoffen. Slecht gereguleerde garnalenkwekerijen zorgen ervoor dat mangroven worden geklaard en leveren overtollige voedingsstoffen in het water, resulterend in de overgroei van algen en verstoring van het ecosysteem.

Stedelijke problemen

Terwijl Cambodja wordt geïndustrialiseerd, stromen mensen naar stedelijke gebieden, die te snel groeien om de sanitaire infrastructuur bij te houden. Veel gebieden hebben geen rioolstelsels of zijn op zijn best niet functioneel. Afvalwater en industrieel afvalwater verontreinigen grond- en oppervlaktewater in veel stedelijke gebieden. Gevaarlijk vast afval vindt vaak zijn weg naar het openen van stortplaatsen waar het kan uitspoelen in grondwater of door de wind kan worden geblazen.