Bij het maken van natuurlijke lijm, bijvoorbeeld uit zetmeel of gelatine, vindt tijdens het bereidingsproces een chemische verandering plaats waarbij grondstoffen worden omgezet in een lijmstof. Lijm op basis van zetmeel wordt bijvoorbeeld gemaakt door zetmeelkorrels in water te koken, waardoor ze worden afgebroken en amylose vrijkomt, een koolhydraat met lange keten dat als hechtmiddel fungeert. Tijdens het koken ondergaat het zetmeel verstijfseling, waarbij de korrels water absorberen en opzwellen, wat leidt tot de vorming van een stroperige, lijmachtige consistentie.

In het geval van lijm op gelatinebasis is deze afgeleid van collageen, een eiwit dat voorkomt in dierlijke bindweefsels (zoals huid, botten en pezen). Wanneer deze weefsels in water worden gekookt, wordt het collageen afgebroken tot gelatine, een in water oplosbare verbinding die bij afkoeling een gelei vormt. Bij gebruik als lijm vormt de gelatineoplossing een sterke lijmverbinding terwijl deze stolt.

Deze processen brengen chemische veranderingen met zich mee, waarbij de uitgangsmaterialen (zetmeel of collageen) een transformatie ondergaan in nieuwe stoffen (pasta op basis van amylose of gelatine) met hechtende eigenschappen. Deze transformaties vereisen energie-input, meestal in de vorm van warmte tijdens het koken, om de noodzakelijke chemische reacties en veranderingen in moleculaire structuren te vergemakkelijken. Er treedt dus wel een verandering in energie op bij het maken van natuurlijke lijm.