* zuurgraad versus basiciteit: Zuurgraad en basiciteit worden gedefinieerd door de neiging om protonen (H+ ionen) te doneren of te accepteren. Zuren doneren protonen, terwijl basen protonen accepteren.

* aminozuurstructuur: Aminozuren bevatten zowel een aminogroep (-NH2) als een carboxylgroep (-cooh). De carboxylgroep is het deel dat zuur kan zijn, omdat het een proton kan doneren en negatief wordt geladen. Het is echter niet de negatieve lading zelf die een aminozuurzuur maakt.

* negatief geladen aminozuren: Negatief geladen aminozuren zijn die waar de zijketen (de "R" -groep) al negatief wordt geladen bij fysiologische pH. Dit betekent meestal dat de zijketen een carboxylgroep of een sulfonaatgroep (-SO3H) bevat. Deze groepen zijn al gedeprotoneerd en hebben een negatieve lading. Ze accepteren protonen, waardoor ze fundamenteel zijn.

* Voorbeelden: Asparaginezuur (ASP, D) en glutaminezuur (Glu, E) zijn voorbeelden van negatief geladen aminozuren. Hun zijketens bevatten carboxylgroepen die worden gedeprotoneerd bij fysiologische pH.

Samenvattend:

Negatief geladen aminozuren zijn BASIC Omdat hun zijketens al negatief zijn geladen en daarom kunnen accepteren protonen. Het is een veel voorkomende misvatting om negatieve lading te associëren met zuurgraad, maar de zuurgraad wordt bepaald door het vermogen om protonen te doneren.