Dit is waarom:

* primaire structuur Verwijst naar de lineaire sequentie van aminozuren in een polypeptideketen. De aminozuren zijn aan elkaar verbonden door peptidebindingen , die covalent zijn obligaties.

* Secundaire structuur (Alpha-helices en bèta-vellen) wordt gestabiliseerd door waterstofbruggen tussen de ruggengraatatomen van de polypeptideketen.

* Tertiaire structuur (De 3D -vorm van een enkele polypeptideketen) wordt gestabiliseerd door verschillende interacties, waaronder waterstofbruggen, ionische bindingen, hydrofobe interacties en disulfidebruggen (die covalente bindingen zijn tussen cysteïneresten).

* Quaternaire structuur (De opstelling van meerdere polypeptideketens in een eiwitcomplex) wordt ook gestabiliseerd door dezelfde interacties als tertiaire structuur.

Dus, terwijl covalente bindingen een rol spelen in tertiaire structuur (disulfidebruggen), de primaire structuur is het enige niveau dat direct is gedefinieerd en bij elkaar gehouden door covalente bindingen (peptidebindingen).