In het IO4-ion is het jodiumatoom omgeven door vier zuurstofatomen, waardoor een tetraëdrische structuur ontstaat. De bindingshoek tussen het jodiumatoom en elk zuurstofatoom is 109,5 graden. Deze hoek komt overeen met de tetraëdrische geometrie van het ion, dat vier gelijkwaardige bindingen heeft van het jodiumatoom tot de vier zuurstofatomen.