Puimsteen is wit vanwege het hoge silicagehalte in het magma waaruit het ontstaat. Silica is een kleurloos mineraal dat het grootste deel van de aardkorst vormt. Wanneer magma met een hoog gehalte aan silica afkoelt en stolt, vormt het lichtgekleurde rotsen zoals puimsteen.

Als magma een hoge concentratie ijzer, magnesium en andere donkergekleurde mineralen bevat, zal het resulterende gesteente donker van kleur zijn. Basalt is bijvoorbeeld een donkergekleurd gesteente dat ontstaat door de afkoeling van magma met een hoog ijzer- en magnesiumgehalte.

Bovendien bevat puimsteen veel microscopisch kleine belletjes, die het licht in alle richtingen verstrooien. Dit geeft puimsteen zijn karakteristieke schuimige en lichtgewicht uiterlijk en draagt ​​bij aan de witte kleur.