Het aantal waterstofatomen vergeleken met zuurstofatomen in een aminozuur kan variëren afhankelijk van het specifieke aminozuur. Gemiddeld bevatten aminozuren echter doorgaans meer waterstofatomen vergeleken met zuurstofatomen. Dit komt omdat de aminozuurstructuur bestaat uit een centraal koolstofatoom gebonden aan een aminogroep (-NH2), een carboxylgroep (-COOH), een zijketen (R) en een waterstofatoom. De aminogroep bevat twee waterstofatomen, terwijl de carboxylgroep één zuurstofatoom bevat. De zijketen (R) kan qua structuur en samenstelling variëren en kan extra waterstofatomen bijdragen.

Glycine, het eenvoudigste aminozuur, heeft bijvoorbeeld de formule NH2-CH2-COOH. Het bevat vier waterstofatomen en twee zuurstofatomen. Aan de andere kant heeft asparagine, een ander aminozuur, de formule NH2-CH(CH2-CONH2)-COOH. Het bevat acht waterstofatomen en drie zuurstofatomen.

Over het algemeen hebben aminozuren de neiging een hogere verhouding van waterstofatomen tot zuurstofatomen te hebben vanwege de aanwezigheid van waterstofatomen in de aminogroep en de variabele zijketens. Het exacte aantal waterstof- en zuurstofatomen kan echter variëren tussen verschillende aminozuren.