Covalente bindingen worden gevormd wanneer twee atomen elektronen delen. In nucleïnezuren zijn de atomen die covalent gebonden zijn koolstof, stikstof, zuurstof, waterstof en fosfor. De covalente bindingen in nucleïnezuren zijn erg sterk en daarom zijn nucleïnezuren zo stabiel.

Ionische bindingen worden gevormd wanneer een atoom een ​​elektron aan een ander atoom doneert. In nucleïnezuren zijn er geen ionische bindingen omdat alle atomen elektronen delen.