1). Aantal protonen in een atoom: Het atoomnummer van een atoom is gelijk aan het aantal protonen in de kern. Protonen hebben een positieve elektrische lading en het aantal protonen bepaalt de algehele positieve lading van de kern.

2) Unieke identificatiecode: Elk element in het periodiek systeem heeft een uniek atoomnummer. Waterstof heeft bijvoorbeeld een atoomnummer van 1, koolstof heeft een atoomnummer van 6 en zuurstof heeft een atoomnummer van 8. Deze atoomnummers onderscheiden elementen van elkaar.

3). Elementidentiteit: Het atoomnummer definieert het element waartoe een atoom behoort. Atomen met verschillende atoomnummers behoren tot verschillende elementen.

4). Rangschikking in het periodiek systeem: Elementen in het periodiek systeem zijn gerangschikt in volgorde van oplopend atoomnummer, waardoor het atoomnummer een fundamenteel organiserend principe van het periodiek systeem is.

5). Chemisch gedrag: Het atoomnummer beïnvloedt het chemische gedrag van atomen, aangezien het aantal protonen de elektronenconfiguratie en valentie-elektronen bepaalt die beschikbaar zijn voor binding.