Waterstofbruggen zijn over het algemeen sterker dan coördinaatbindingen. Waterstofbindingen worden gevormd tussen een waterstofatoom en een elektronegatief atoom zoals stikstof, zuurstof of fluor. Het elektronegatieve atoom trekt de elektronen in de waterstofbrug aan, waardoor een gedeeltelijke positieve lading op het waterstofatoom ontstaat en een gedeeltelijke negatieve lading op het elektronegatieve atoom. Deze elektrostatische aantrekkingskracht houdt de waterstofbrug bij elkaar.

Coördinatiebindingen, ook wel datieve bindingen genoemd, worden gevormd wanneer een atoom een ​​paar elektronen aan een ander atoom doneert. Het atoom dat de elektronen doneert, wordt de Lewis-base genoemd, en het atoom dat de elektronen accepteert, wordt het Lewis-zuur genoemd. Coördinaatbindingen zijn zwakker dan waterstofbruggen omdat de elektrostatische aantrekkingskracht tussen de twee atomen zwakker is. Dit komt omdat de elektronen in een coördinaatbinding niet gelijkelijk verdeeld zijn tussen de twee atomen, zoals in een waterstofbinding.

Over het algemeen zijn waterstofbruggen ongeveer 10 keer sterker dan coördinaatbindingen. De sterkte van een waterstofbinding of een coördinaatbinding kan echter variëren, afhankelijk van de specifieke betrokken atomen.