Science >> Wetenschap >  >> Chemie

Onderzoeker stelt een paradigmaverschuiving voor in de biochemie van enzymen

P450 51 enzymen demethyleren sterolen, waarbij mierenzuur (DCOOH) vrijkomt. Analyse van het DCOOH-bijproduct maakt de mechanistische discriminatie mogelijk van de bijdrage(n) van Verbinding 0 (Cpd 0) en Verbinding I (Cpd I) aan de katalyse. Wanneer enzymreacties werden uitgevoerd onder 18 O2 (rood),>50 % van de opgebrachte DCOOH bevatte één atoom van 18 O (voor alle geteste P450 51-enzymen), indicatief voor de belangrijkste bijdrage van Cpd 0 aan de 24,25-dihydrolanosterol C-C-splitsing. Credit:Angewandte Chemie Internationale Editie (2024). DOI:10.1002/anie.202317711

Hoewel je misschien nog nooit hebt gehoord van de cytochroom P450-superfamilie van enzymen, spelen deze eiwitten diverse en cruciale rollen bij mensen door de metabolische verwerking van medicijnen, pesticiden, vetzuren, in vet oplosbare vitamines en chemische kankerverwekkende stoffen en de biosynthese van essentiële steroïden. inclusief sterolen.



Sterolen zijn een familie van chemische verbindingen die een centrale, ringvormige structuur delen en die van cruciaal belang zijn voor het leven van een groot aantal organismen. De bekendste sterol bij mensen is cholesterol, een belangrijk onderdeel van ons celmembraan en een voortdurend onderwerp in de gedachten van artsen, aangezien verhoogde cholesterolwaarden in het bloed ons risico op hart- en vaatziekten kunnen verhogen.

Het laboratorium van Fred Guengerich, de Tadashi Inagami, Ph.D. Hoogleraar biochemie aan de Vanderbilt Universiteit bestudeert al vijftig jaar cytochromen P450. In een nieuw artikel gepubliceerd in Angewandte Chemie onderzocht het laboratorium van Guengerich het mechanisme dat wordt gebruikt door cytochroom P450 51 – een P450-enzym dat in alle levensfamilies aanwezig is – om een ​​cruciale driestapsreactie in de biosynthese van sterolen te katalyseren:het metabolisme van lanosterol.

"Dit is een uitdagend maar lonend project geweest dat het eerste ondubbelzinnige antwoord biedt op een al lang bestaande en controversiële mechanistische vraag in de eukaryotische sterolbiosynthese", zegt hoofdauteur en afgestudeerd biochemiestudent Kevin McCarty.

De katalytische cyclus van alle P450-enzymen omvat de vorming van twee actieve heem-ijzersoorten – Verbinding 0 en Verbinding I, waarvan de laatste op natuurlijke wijze wordt gevormd uit Verbinding 0 – die nodig zijn voor door P450 gekatalyseerde reacties, waaronder het metabolisme van lanosterol. Hoewel de rol van Compound I in de eerste twee stappen van het lanosterolmetabolisme goed is vastgesteld, hebben tegenstrijdige gegevens van verschillende laboratoria wetenschappers onduidelijk gemaakt of P450 51 Compound 0 of Compound I gebruikt om de cruciale laatste stap te volbrengen.

Door gebruik te maken van een geavanceerde analytische techniek die aanvankelijk werd verfijnd door voormalig Guengerich-postdoc Francis Yoshimoto, waarmee de opname van een zuurstofisotoop met de naam 18 wordt gevolgd O in de producten van de P450-reactie zijn McCarty en collega's de eersten geworden die suggereren dat zowel Verbinding 0 als Verbinding I een actieve chemische rol kunnen spelen in de laatste stap van het lanosterolmetabolisme.

Resultaten gepresenteerd in de Angewandte Chemie Uit onderzoek blijkt dat hoewel Verbinding 0 de belangrijkste heemsoort is die verantwoordelijk is voor de laatste stap van de katalytische werking van menselijk P450 51 (~85% van de reactie), Verbinding I nog steeds een ondergeschikte, kwantificeerbare rol speelt (~14% van de reactie).

In samenwerking met Galina Lepesheva, onderzoeksprofessor in de biochemie, vergeleken de onderzoekers de relatieve bijdragen van elke heemsoort in vier P450 51-enzymen van pathogene gist, amoeben en trypanosomen, een soort parasiet, aan de menselijke ortholoog. Hoewel de gist- en amoebe-enzymen vergelijkbare resultaten lieten zien als het menselijke eiwit, onthulden de resultaten van de trypanosomale enzymen een interessant mechanistisch verschil:verbinding 0 en verbinding I deelden ongeveer gelijke bijdragen aan de reactie.

Deze resultaten voegen diepte toe aan ons collectieve en mechanistische begrip van P450-enzymen, met name de enzymen die betrokken zijn bij de biosynthese van sterolen.

"Dit was een lang project dat een chemische synthese van 17 stappen vereiste, vijf verschillende gezuiverde P450 51-enzymen van onze medewerker prof. Galina Lepesheva, zeer zorgvuldige aandacht voor het gebruik van een atmosfeer van 18 zuurstof in de reacties, geavanceerde massaspectrometrie met hoge resolutie, en zorgvuldig werk van alle auteurs in ons laboratorium”, aldus Guengerich. Volgens hem zorgde de aandacht voor details van zijn team ervoor dat het 'dit systeem kon kraken' en een duidelijke analyse kon maken van een vertakt enzymmechanisme.

"Onze bevindingen bieden een belangrijke vooruitgang in het begrip van de functie van P450 51 bij mensen en verschillende ziekteverwekkers, waarvan we hopen dat ze nuttig zullen zijn bij de voortdurende zoektocht naar op P450 51 gerichte medicijnen", aldus McCarty.

Momenteel remmen een aantal bestaande antischimmelmedicijnen de P450 51-enzymen van de schimmel, waardoor het vermogen van het organisme om essentiële sterolen te maken en zich voort te planten wordt verstoord. Toch onderstreept de resistentie tegen antischimmelmiddelen, in combinatie met het bestaan ​​van levensbedreigende schimmelinfecties waarvoor geen behandeling bestaat, de voortdurende behoefte aan nieuwe, op P450 51 gerichte geneesmiddelen.

Vooruitkijkend zullen de Guengerich en Lepesheva-laboratoria een P450 51-enzym uit amoebe verder analyseren, op zoek naar mechanistische eigenaardigheden die mogelijk kunnen worden geëxploiteerd als potentiële medicijndoelen.

Meer informatie: Kevin D. McCarty et al, Zuurstof-18-labeling onthult een gemengd Fe-O-mechanisme in de laatste stap van cytochroom P450 51 Sterol 14α-demethylering, Angewandte Chemie International Edition (2024). DOI:10.1002/anie.202317711

Aangeboden door Vanderbilt University