science >> Wetenschap >  >> Chemie

Moleculair in kaart brengen gemakkelijk gemaakt

3D-kaart van de moleculen op een geldautomaat. Deze kaart laat zien hoe we moleculen van onze huid overbrengen naar de objecten waarmee we omgaan, het verstrekken van informatie die veel forensische toepassingen kan hebben. Krediet:UC San Diego en EMBL

Elke dag, elke centimeter huid van je lichaam komt in contact met duizenden moleculen - van voedsel, cosmetica, zweet, de microben die je huid thuis noemen. Nu kunnen onderzoekers interactieve 3D-kaarten maken die laten zien waar elke molecuul op je lichaam blijft hangen, dankzij een nieuwe methode ontwikkeld door onderzoekers van de University of California San Diego en European Molecular Biology Laboratory (EMBL). De techniek wordt op 21 december gepubliceerd in Natuurprotocollen .

Het doel van deze 3D-mapping is om beter te begrijpen hoe moleculen uit onze omgeving, evenals die geproduceerd door ons lichaam en de microbiële gemeenschappen op onze huid, beïnvloeden elkaar en onze gezondheid. Toen het team eerder deze aanpak gebruikte om de moleculen op de huid van twee vrijwilligers in kaart te brengen, ze vonden veel voorkomende sporen van zonnebrandcrème en andere hygiëneproducten, zelfs drie dagen nadat ze voor het laatst waren gebruikt.

De 3D moleculaire mapping methode is het geesteskind van Pieter Dorrestein, doctoraat, professor aan de UC San Diego School of Medicine en Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, Theodore Alexandrov, doctoraat, teamleider bij EMBL in Duitsland, en hun teams. Ze bepaalden hoe de monsters het beste konden worden verzameld, hun chemische samenstelling bepalen met behulp van massaspectrometrie, en bouw de kaartsoftware die voor analyse wordt gebruikt.

Nadat ze waren benaderd door vele collega's uit uiteenlopende vakgebieden als forensisch onderzoek, cosmetica, ecologie en landbouw, de onderzoekers hebben de 3D-methode voor moleculaire mapping omgezet in een stapsgewijs recept met intuïtieve software en beschikbaar gesteld aan de wereldwijde wetenschappelijke gemeenschap.

3D-kaart van de moleculen op een rozemarijnveer. De oude bladeren aan de onderkant van de rozemarijnplant bevatten veel hogere niveaus van het flavonoïde cirsimaretin dan de nieuwere bladeren aan de bovenkant. Met behulp van kaarten zoals deze, wetenschappers kunnen bestuderen hoe planten moleculen transporteren van oude bladeren naar jonge bladeren, of hoe ze reageren op stress. Krediet:UC San Diego en EMBL