Hij voerde een reeks experimenten uit in het midden van de 19e eeuw met behulp van zwanenhalsflessen. Hij kookte rundvleesbouillon in de kolven, die de bouillonsteriliseerden. Sommige kolven hadden hun nek gebogen in een S-vormige, van het vangen van microben in de lucht. Anderen hadden hun nek gebroken en stelden de bouillon aan de lucht bloot.

Hij merkte op dat de bouillon in de zwanenhalskolfen duidelijk bleef, terwijl de bouillon in de gebroken nekkolfen bewolkt werd vanwege microbiële groei. Dit toonde aan dat de microben niet spontaan in de bouillon werden gegenereerd, maar eerder uit de lucht kwamen.

Dit experiment was een cruciale stap in het weerleggen van de theorie van spontane generatie en het ondersteunen van de biogenese theorie, die stelt dat alle levende organismen afkomstig zijn van reeds bestaande levende organismen.