1. Fossil Record: Fossielen bieden in het verleden een direct verslag van het leven. Ze tonen een progressie van organismen in de loop van de tijd, met oudere fossielen over het algemeen eenvoudiger dan nieuwere. Dit ondersteunt het idee van geleidelijke verandering en afdaling met modificatie. Bovendien vertonen overgangsfossielen (zoals Archaeopteryx, die kenmerken van zowel reptielen als vogels hebben) evolutionaire verbanden tussen verschillende groepen.

2. Vergelijkende anatomie: De anatomische overeenkomsten tussen verschillende soorten suggereren gemeenschappelijke afkomst. Bijvoorbeeld, de botstructuur van een menselijke arm, een vleermuisvleugel, een walvisschuim en een paardenpoot zijn opmerkelijk vergelijkbaar, hoewel deze structuren verschillende functies dienen. Dit wordt verklaard door afkomst van een gemeenschappelijke voorouder met een vergelijkbare skeletstructuur.

3. DNA en moleculaire biologie: De genetische code (DNA) is universeel in alle levensvormen, wat een gemeenschappelijke oorsprong suggereert. Door DNA -sequenties tussen verschillende soorten te vergelijken, kunnen we evolutionaire relaties reconstrueren en schatten hoe nauw verwante soorten zijn. Bovendien ondersteunt de aanwezigheid van homologe genen (genen met vergelijkbare sequenties in verschillende soorten) verder het idee van gedeelde afkomst en evolutionaire verandering.