Microbiologie omvat de studie van:

* bacteriën: eencellige prokaryoten

* archaea: Een ander type eencellige prokaryote

* Fungi: eukaryotische organismen, inclusief schimmels, gisten en champignons

* protozoa: eencellige eukaryotische organismen

* virussen: niet-levende entiteiten die een gastheer vereisen om te repliceren

* algen: fotosynthetische eukaryotische organismen

Microbiologen bestuderen de kenmerken, groei, metabolisme, genetica en interacties van deze organismen. Ze onderzoeken ook de rollen die ze spelen in het milieu, de menselijke gezondheid en de industrie.