1. Herkenningsequentie:

* specificiteit: Elk restrictie -enzym herkent een specifieke, korte sequentie van DNA -nucleotiden. Deze reeks is meestal 4-8 basenparen lang en wordt de herkenningssequentie genoemd of BEPERKINGSITE .

* Palindromic Nature: Veel herkenningssequenties zijn palindromisch, wat betekent dat ze hetzelfde achteruit en vooruit lezen op de tegenovergestelde DNA -strengen. De enzym ecori herkent bijvoorbeeld de sequentiegatatc, die hetzelfde is als u deze van rechts naar links leest op de complementaire streng (CTTAAG).

2. Splitsing:

* Knippen: Zodra het restrictie -enzym zijn herkenningssequentie vindt, snijdt het het DNA -molecuul op een specifiek punt binnen die sequentie.

* Sticky Ends versus botte uiteinden: De manier waarop een beperkingsenzymsnijdingen "plakkerige uiteinden" of "stompe uiteinden" kunnen produceren.

* Sticky Ends: Het enzym snijdt de DNA-strengen op verschillende posities, waardoor korte enkelstrengige overhangen achterblijven die kunnen baseren met complementaire overhangen van andere DNA-moleculen gesneden met hetzelfde enzym. Dit is handig voor het creëren van recombinante DNA -moleculen.

* BOLT EINDE: Het enzym snijdt beide DNA -strengen op dezelfde positie, waardoor geen overhangen achterblijven.

Samenvattend:

De volgende factoren bepalen hoe een restrictie -enzym DNA zal snijden:

* De specifieke herkenningssequentie van het enzym.

* De locatie van die sequentie binnen het DNA -molecuul.

* Het specifieke splitsingspatroon van het enzym (plakkerige uiteinden versus stompe uiteinden).

Voorbeeld:

Het enzym ecori snijdt DNA bij de sequentie -basatie en produceert plakkerige uiteinden. Dit betekent dat het elk DNA-molecuul dat die sequentie bevat, snijdt, en de resulterende DNA-fragmenten zullen enkelstrengige overhangen hebben die kunnen worden gebruikt voor het klonen of andere genetische manipulaties.