1. Celwand: Deze stijve buitenlaag biedt vorm en bescherming aan de cel. Het is gemaakt van peptidoglycan, een uniek molecuul dat alleen in bacteriën wordt gevonden. De structuur van de celwand wordt gebruikt om bacteriën in twee hoofdgroepen te classificeren:gram-positief en gram-negatief.

2. ribosomen: Deze zijn essentieel voor eiwitsynthese. Bacteriën hebben ribosomen uit de jaren 70, die kleiner zijn dan de ribosomen uit de jaren 80 die worden gevonden in eukaryotische cellen. Dit verschil is belangrijk voor de ontwikkeling van antibiotica die zich richten op bacteriële ribosomen zonder menselijke cellen te schaden.

Er zijn veel andere belangrijke structuren in bacteriën, maar deze twee zijn essentieel voor hun overleving en functie.