1. Fossiel bewijs:

* stromatolieten: Deze gelaagde rotsformaties worden gevormd door de activiteit van microbiële matten, voornamelijk cyanobacteriën. Enkele van de oudste bekende fossielen zijn stromatolieten, daterend uit 3,5 miljard jaar geleden. Dit suggereert dat het prokaryotische leven op dat moment al op aarde aanwezig was.

* Microfossielen: Microscopische fossielen die lijken op prokaryoten zijn gevonden in rotsen die teruggaan tot 3,8 miljard jaar geleden. Hoewel deze fossielen moeilijker te interpreteren zijn, bieden ze verdere ondersteuning voor het vroege prokaryotische leven.

2. Biochemisch bewijs:

* Universele genetische code: Alle levende organismen gebruiken dezelfde genetische code, wat een gemeenschappelijke voorouder suggereert. Prokaryoten hebben een eenvoudigere genetische code en machines in vergelijking met eukaryoten, die aansluiten bij het idee dat ze de eerste waren die evolueerden.

* Metabole paden: Veel essentiële metabole paden die in alle levende organismen worden gevonden, zijn aanwezig in prokaryoten, wat hun oude oorsprong aangeeft.

3. De harde vroege aarde:

* vroege aardomgeving: De vroege aarde was heel anders dan vandaag, met een harde en vijandige omgeving. Prokaryoten zijn extreem aanpasbaar en kunnen gedijen in extreme omgevingen zoals warmwaterbronnen, vulkanische ventilatieopeningen en zoutmeren. Dit maakt hen ideale kandidaten om de omstandigheden op vroege aarde te overleven.

4. Evolutietheorie:

* eenvoud van prokaryotische structuur: Prokaryoten zijn eenvoudiger van structuur in vergelijking met eukaryoten, zonder een kern en andere complexe organellen. Deze eenvoud suggereert dat ze eerder evolueerden en later aanleiding gaven tot complexere levensvormen.

5. Fylogenetische analyse:

* fylogenetische bomen: Op basis van genetische vergelijkingen suggereren fylogenetische bomen dat prokaryoten aan de basis van de levensboom bevinden, wat hun vroege afkomst aangeeft.

Hoewel het fossiele record niet helemaal voltooid is, suggereert het gecombineerde bewijs van fossielen, biochemie, evolutietheorie en fylogenetische analyse sterk dat prokaryoten de eerste organismen waren die op aarde opduiken.