Hoewel er twee hoofddomeinen van prokaryoten zijn:bacteriën en archaea, zijn bacteriën veel overvloediger en diverser dan Archaea. Ze worden gevonden in bijna elke omgeving op aarde, van de diepste oceanen tot de hoogste bergen.

Dit is de reden waarom bacteriën als de meest voorkomende worden beschouwd:

* overvloed: Ze worden geschat op de meest talrijke organismen op aarde, die alle andere organismen samenvallen.

* Diversiteit: Ze omvatten een enorm scala aan soorten met verschillende metabolismen en aanpassingen.

* ubiquity: Ze zijn te vinden in bijna elke omgeving, van grond en water tot de menselijke darm en zelfs extreme omgevingen zoals warmwaterbronnen en hydrothermische ventilatieopeningen.

Hoewel Archaea ook fascinerend is en belangrijke rollen spelen in ecosystemen, zijn hun aantal en diversiteit aanzienlijk lager dan die van bacteriën.