* Complexiteit: Eukaryotische cellen zijn veel complexer dan prokaryotische cellen. Ze hebben een kern, membraangebonden organellen en een breder scala aan functies. Deze complexiteit vereist een grotere hoeveelheid genetische informatie om te coderen.

* lineaire chromosomen: Eukaryotisch DNA is georganiseerd in lineaire chromosomen, die meestal meervoudig en veel groter zijn dan het enkele, cirkelvormige chromosoom dat in prokaryoten wordt aangetroffen.

* Niet-coderend DNA: Eukaryotische genomen bevatten een significante hoeveelheid niet-coderend DNA, dat niet direct codeert voor eiwitten. Dit omvat regulerende sequenties, introns en repetitieve elementen.

Samenvattend vereisen de grotere complexiteit en organisatie van eukaryotische cellen een grotere hoeveelheid DNA in vergelijking met prokaryoten.