Plantenziekten:

* oomycetes: Dit zijn geen echte schimmels maar hebben vergelijkbare kenmerken. Ze zijn verantwoordelijk voor ziekten zoals late plaag van aardappel (veroorzaakt door *phytophthora infestans *), dapperige meeldauw van druiven (veroorzaakt door *plasmopara viticola *) en wortelrot (veroorzaakt door *pythium *soorten).

* ascomyceten: Deze schimmels produceren sporen in SACS genaamd ASCI. Ze veroorzaken een breed scala aan plantenziekten, waaronder poederachtige meeldauw (veroorzaakt door *erysiphe *soorten), appelschurft (veroorzaakt door *Venturia inaequalis *) en Nederlandse iepziekte (veroorzaakt door *Ophiostoma ulmi *).

* basidiomycetes: Deze schimmels produceren sporen op clubvormige structuren genaamd Basidia. Ze veroorzaken ziekten zoals roest (veroorzaakt door * puccinia * soorten), smuts (veroorzaakt door * ustilago * soorten) en sommige wortelrots.

* zygomycetes: Deze schimmels produceren sporen in een structuur die een zygospore wordt genoemd. Ze zijn verantwoordelijk voor sommige wortelrots en zachte rots.

menselijke ziekten:

* dermatophytes: Deze schimmels infecteren de huid, het haar en de nagels, waardoor ziekten zoals atleet's voet, ringworm en jock jeuk veroorzaken. Gemeenschappelijke voorbeelden zijn *Trichophyton *, *Microsporum *en *Epidermophyton *soorten.

* opportunistische schimmels: Deze schimmels zijn normaal gesproken onschadelijk bij gezonde personen, maar kunnen infecties veroorzaken bij mensen met een verzwakt immuunsysteem. Voorbeelden zijn *Aspergillus *, *Candida *en *Cryptococcus *soorten.

* Systemische schimmels: Deze schimmels kunnen zich over het hele lichaam verspreiden, wat ernstige infecties veroorzaakt. Voorbeelden zijn * histoplasma capsulatum * (histoplasmose), * blastomyces dermatitidis * (blastomycosis) en * coccidioides immitis * (coccidioidomycosis).

Het is belangrijk op te merken dat dit geen uitputtende lijst is, en er zijn veel andere soorten schimmels die ziekten kunnen veroorzaken bij zowel planten als mensen. Het specifieke type schimmel dat verantwoordelijk is voor een bepaalde ziekte zal afhangen van factoren zoals het gastheerorganisme, omgevingscondities en de biologie van de schimmel.