- Menselijke activiteiten :Menselijke activiteiten zoals ontbossing, vervuiling en overbevissing kunnen de voedselketen verstoren door de beschikbaarheid van voedselbronnen te verminderen of de habitat van organismen te veranderen.

- Klimaatverandering :Veranderingen in het klimaat, zoals stijgende temperaturen en veranderde neerslagpatronen, kunnen de verspreiding en overvloed van organismen beïnvloeden, wat leidt tot veranderingen in de voedselketen. Warmere temperaturen kunnen er bijvoorbeeld voor zorgen dat bepaalde plantensoorten gedijen terwijl andere achteruitgaan, wat gevolgen heeft voor de herbivoren en roofdieren die van hen afhankelijk zijn voor hun voedsel.

- Invasieve soorten :Invasieve soorten kunnen de voedselketen verstoren door met inheemse soorten te concurreren om hulpbronnen zoals voedsel en leefgebied. Ze kunnen ook jagen op inheemse soorten of ziekten overbrengen, wat leidt tot bevolkingsafname en veranderingen in de structuur van de voedselketen.

- Ziekten :Ziekten kunnen zich verspreiden onder organismen in de voedselketen, waardoor de bevolking afneemt en de stroom van energie en voedingsstoffen wordt verstoord. Een ziekte-uitbraak in een populatie herbivoren kan bijvoorbeeld hun aantal verminderen, wat leidt tot een toename van de plantensoorten die ze consumeren en een afname van het aantal roofdieren dat ervan afhankelijk is.

- Natuurrampen :Natuurrampen zoals overstromingen, bosbranden en droogtes kunnen habitatvernietiging veroorzaken en de voedselketen ontwrichten door de beschikbaarheid van voedselbronnen en onderdak te veranderen. Deze gebeurtenissen kunnen ook leiden tot populatieafname en veranderingen in de soortensamenstelling.

- Evolutie en aanpassing :In de loop van de tijd kunnen organismen evolueren en zich aanpassen aan veranderingen in hun omgeving, wat leidt tot verschuivingen in de voedselketen. Sommige soorten kunnen bijvoorbeeld nieuwe eigenschappen of gedrag ontwikkelen waardoor ze toegang krijgen tot nieuwe voedselbronnen of roofdieren kunnen vermijden, waardoor hun rol in de voedselketen verandert.