Science >> Wetenschap >  >> Biologie

Laatste verdedigingslinie:hoe bacteriepopulaties worden beschermd tegen virale infecties

Het laatste verdedigingsmechanisme dat bacteriële populaties gebruiken om zichzelf tegen virale infecties te beschermen, staat gezamenlijk bekend als de geclusterde, regelmatig op afstand gelegen korte palindromische herhalingen (CRISPR) – CRISPR-geassocieerde proteïne 9 (Cas9) -systemen, vaak CRISPR-Cas-systemen genoemd. CRISPR-Cas-systemen voorzien prokaryoten van een adaptieve en erfelijke immuniteit tegen binnendringend viraal DNA of RNA. Laten we ons verdiepen in de werking van dit ongelooflijke verdedigingsmechanisme:

1. CRISPR-array-acquisitie :

Tijdens een virale invasie vangen bacteriën korte fragmenten van het virale DNA op en integreren ze in hun eigen genoom. Deze fragmenten staan ​​bekend als proto-spacers en worden opgeslagen in specifieke loci die CRISPR-arrays worden genoemd. Elke proto-spacer wordt geflankeerd door geconserveerde sequenties die bekend staan ​​als directe herhalingen.

2. Transcriptie en verwerking van CRISPR-RNA (crRNA) :

De CRISPR-arrays worden getranscribeerd in een precursor-CRISPR-RNA-molecuul (pre-crRNA). Dit pre-crRNA wordt vervolgens verwerkt door de Cas-eiwitten, waardoor volwassen crRNA's worden gegenereerd die kort zijn en een specifieke sequentie bevatten die complementair is aan het binnendringende virale DNA of RNA.

3. Targeting en splitsing van virale nucleïnezuren:

Het volwassen crRNA associeert zich met specifieke Cas-eiwitten en vormt een ribonucleoproteïnecomplex. Dit complex fungeert als een moleculaire gids en stuurt Cas-eiwitten naar het binnendringende virale DNA of RNA. Bij herkenning van de complementaire sequentie splitsen en vernietigen de Cas-eiwitten de virale nucleïnezuren.

4. Geheugen en aanpassing :

CRISPR-Cas-systemen vertonen immunologisch geheugen. Zodra een virus is aangetroffen en verslagen, wordt de proto-spacer-sequentie van dat virus geïntegreerd in de CRISPR-array van de gastheer, waardoor de gastheer een snelle en robuuste verdediging kan opzetten tegen daaropvolgende infecties door hetzelfde virus.

5. Soorten CRISPR-Cas-systemen :

Er zijn verschillende typen CRISPR-Cas-systemen, onderverdeeld in zes hoofdtypen (types I tot en met VI) en nog meer subtypen. Elk type maakt gebruik van verschillende sets Cas-eiwitten en mechanismen voor het richten en splitsen van nucleïnezuren.

6. CRISPR-Cas9-toepassingen in de biotechnologie :

Het CRISPR-Cas9-systeem, met name Type II, heeft een enorme populariteit verworven als een veelzijdig hulpmiddel voor het bewerken van genen in de biotechnologie. Door gebruik te maken van zijn vermogen om specifieke DNA-sequenties te targeten, maakt CRISPR-Cas9 nauwkeurige modificaties van genomen mogelijk voor verschillende onderzoeks- en therapeutische toepassingen.

Concluderend vertegenwoordigen de CRISPR-Cas-systemen een verbazingwekkend en ingewikkeld verdedigingsmechanisme dat door bacteriepopulaties is ontwikkeld om virale invasies te bestrijden. Deze systemen bieden een adaptieve en erfelijke immuniteit, waardoor bacteriën generaties lang worden beschermd tegen virale infecties. Bovendien hebben de toepassingen van CRISPR-Cas-technologie in de biotechnologie een revolutie teweeggebracht in de genetische manipulatie en bieden ze een enorm potentieel voor toekomstige wetenschappelijke vooruitgang en therapeutische interventies.