Heterotrofe bacteriën zijn een soort bacteriën die de suikers nemen die ze nodig hebben om te overleven en zich uit hun omgeving te reproduceren, in plaats van de suikers zelf te maken van koolstof en waterstof. Bacteriën die hun eigen suikers produceren uit koolstof en waterstof worden autotroof genoemd. Er zijn veel verschillende subtypes van heterotrofe bacteriën.

Foto-heterotrofen

Photoheterotroph is de term die wordt gebruikt om bacteriën te beschrijven die energie uit zonlicht halen, maar organische verbindingen zoals suikers uit hun omgeving nodig hebben om te overleven. Voorbeelden van photoheterotrofe bacteriën zijn heliobacteriën, groene niet-zwavelbacteriën en paarse niet-zwavelbacteriën.

Chemoheterotrophs

Chemoheterotroof is de term die wordt gebruikt om bacteriën te beschrijven die energie halen uit chemische reacties. Zoals alle heterotrofen hebben ze organische verbindingen nodig om te overleven en kunnen ze hun eigen stoffen niet aanmaken. Chemoheterotrophs worden vaak aangetroffen rond thermische ventilatieopeningen in de diepe oceaan.

Organotrophs

Organotroph is de term die wordt gebruikt om bacteriën te beschrijven die hun energie verkrijgen van een organisch substraat. Voorbeelden van hetero-organotrofen zijn de bacteriën die betrokken zijn bij compostering.

Lithotrofen

Lithotroph is de term die wordt gebruikt om bacteriën te beschrijven die hun energie van een anorganisch substraat verkrijgen. Heterolithotrofe bacteriën zijn zeer zeldzaam.