science >> Wetenschap >  >> Biologie

Interferentie berekenen

Chromosomale crossover, ook wel genetische crossover genoemd, is een normaal proces waarbij genen recombineren. De recombinatie vergroot de genetische variatie door recombinatie om verschillende eigenschappen te produceren.

TL; DR (te lang; niet gelezen)

Geninterferentie is een maat voor de onafhankelijkheid van crossovers van elkaar. Als een crossover in het ene gebied een crossover in een ander gebied beïnvloedt, wordt die interactie interferentie genoemd. Interferentie \u003d 1 - c.o.c., waarbij c.o.c. is de coëfficiënt van toeval (c.o.c.)

Mensen hebben 23 chromosomen. Tijdens meiose deelt een cel tweemaal om vier dochtercellen te vormen. Deze vier dochtercellen hebben de helft van het aantal chromosomen van de oudercel. Ze kunnen dan samengaan met een andere chromosomale helft van het ei of het sperma om een heel paar te worden.

Soms blijven deze twee delen niet bij elkaar. Als de stukken breken, kunnen ze zich aansluiten bij een ander gebroken stuk. De twee genetische kopieën die recombineren worden chromatiden genoemd. Problemen zoals het syndroom van Down of andere genetische aandoeningen kunnen worden veroorzaakt wanneer genen onjuist worden gecombineerd.

De meeste cross-overs treden normaal op. Af en toe treedt een dubbele crossover op. Dit is wanneer de chromatiden samenkomen op twee punten in plaats van één. Op het tweede contactpunt kunnen de chromatiden opnieuw genetische informatie uitwisselen en opnieuw uitwisselen.

Geninterferentie is een maat voor de onafhankelijkheid van crossovers van elkaar. Met andere woorden, omdat u weet dat dubbele crossovers voorkomen, moet u de vraag beantwoorden of crossovers in aangrenzende chromosoomgebieden onafhankelijk zijn of niet. Als ze niet onafhankelijk zijn, betekent dit dat een crossover in één regio de kans op een crossover in een aangrenzend gebied beïnvloedt. Als een crossover in de ene regio een crossover in een andere regio beïnvloedt, wordt die interactie interferentie genoemd.
Interferentie berekenen

Wanneer wordt overwogen hoe interferentie te berekenen, is de eerste stap het berekenen van de coëfficiënt (coc). De c.o.c. hangt op zijn beurt af van de waarschijnlijkheid van een dubbele crossover, de zogenaamde crossover-frequentiewaarde, ook bekend als de "frequentie van dubbele recombinanten."

De coëfficiëntcoëfficiënt is de verhouding tussen de waargenomen en verwachte dubbele recombinanten.

coëfficiënt van coïncidentie \u003d waargenomen frequentie dubbele recombinanten /verwachte frequentie dubbele recombinanten

Het verwachte aantal dubbele recombinanten in een steekproef van twee onafhankelijke regio's is gelijk aan het product van de recombinante frequenties in de aangrenzende regio's.

Interferentie wordt dan als volgt gedefinieerd:

interferentie \u003d 1 - coc

Interferentie vertelt u hoe sterk een crossover in een van de DNA-regio's de vorming van een crossover belemmert in het andere gebied.

Als interferentie nul is, betekent dit dat de dubbele cross-overs plaatsvinden zoals voorspeld en dat een cross-over in een regio onafhankelijk van een cross-over in een aangrenzend gebied plaatsvindt.

Als interferentie is 1, dit betekent dat interferentie volledig is en dat er geen dubbele crossovers worden waargenomen omdat een crossover in één regio de kans op een crossover in een aangrenzende regio elimineert.

Meestal zullen uw gegevens een interferentie tussen 0 en 1 laten zien. Waarden hoger dan nul maar minder dan één geeft aan dat er interferentie optreedt