science >> Wetenschap >  >> nanotechnologie

Ontspanning van DNA-strengen door gebruik te maken van nanokanalen

DNA in een nanokanaal. Krediet:SISSA

Een eenvoudige en effectieve manier om de vaak verwarde massa DNA te ontrafelen, is door de streng in een nanokanaal te 'rijgen'. Een studie uitgevoerd met de deelname van de International School for Advanced Studies in Triëst, gebruikte simulaties om de kenmerken te meten die dit kanaal zou moeten hebben om maximale efficiëntie te bereiken.

Met het wijdverbreide gebruik van methoden voor DNA-analyse en manipulatie, het is zeker nuttig om een ​​manier te vinden om de strengen van dit molecuul, dat de neiging heeft spontaan in de knoop te raken, te ontrafelen en te ontspannen. Een manier is om kanalen te gebruiken, of liever nanokanalen, als Cristian Micheletti, SISSA-onderzoeker, en Enzo Orlandini, van de Universiteit van Padua, deed in een onderzoek dat net in het tijdschrift is gepubliceerd Macrobrieven .

Het idee is om het DNA in het kanaal te dwingen om het volledig te ontspannen. "Maar niet zomaar een kanaal is geschikt, " legt Micheletti uit. "Afhankelijk van de diameter van het nanokanaal, de uiteinden van de streng kunnen zich in haakachtige structuren schikken die uiteindelijk een knoop zullen vormen".

"In onze studie hebben we simulatietechnieken gebruikt om de mechanismen te karakteriseren die leiden tot knoopvorming als een functie van de diameter van het kanaal", Micheletti gaat verder.

Dit is een model-DNA-keten in een nanokanaal van 100 nm breed. De spontane dynamische evolutie van het DNA gaat gepaard met frequente knopen en verstrengeling aan de uiteinden van de ketting. Krediet:SISSA

Dit is een model-DNA-keten in een nanokanaal van 100 nm breed. De spontane dynamische evolutie van het DNA gaat gepaard met frequente knopen en verstrengeling aan de uiteinden van de ketting. Krediet:SISSA