1. Tropisch nat en droog (savanne): Dit is het meest voorkomende klimaattype in het bassin, dat het grootste deel van het gebied bedekt. Het wordt gekenmerkt door een duidelijk nat seizoen (meestal van mei tot oktober) met zware regenval, gevolgd door een lang droog seizoen (van november tot april) met weinig tot geen regen. De temperaturen zijn over het algemeen het hele jaar door hoog, met een lichte druppel tijdens het droge seizoen.

2. semi-arid (steppe): Dit klimaattype komt voor in de noordelijke en oostelijke delen van het bekken, grenzend aan de Sahara -woestijn. Het ontvangt minder regenval dan de savanne, met een korter nat seizoen en een langer, meer uitgesproken droge seizoen. Temperaturen zijn overdag extreem heet, met koele nachten.

3. arid (woestijn): Dit klimaattype wordt gevonden in het uiterste noorden van het bassin, in de Sahara -woestijn zelf. Regenval is extreem schaars, vaak minder dan 100 mm per jaar. De temperaturen zijn het hele jaar door erg heet en bereiken extreme hoogtepunten tijdens de zomermaanden.

Dit zijn slechts de belangrijkste klimaattypen in het Niger River Basin. Binnen elk van deze zijn er variaties in regenval, temperatuur en andere factoren die bijdragen aan een divers scala aan microklimaten over het bassin.