Wetenschap
Krediet:Santa Fe Instituut
Geavanceerde netwerkanalyse betekent het vinden van relaties die vaak niet gemakkelijk te zien zijn. Een netwerk kan vele lagen hebben, die overeenkomen met verschillende soorten relaties in een sociaal netwerk, bijvoorbeeld, maar de traditionele benaderingen van analyse zijn beperkt. Ze hebben de neiging om netwerken af te vlakken tot enkele lagen, of behandel lagen onafhankelijk van de anderen.
Een nieuw algoritme van een interdisciplinair team bij SFI identificeert niet alleen relaties binnen individuele lagen, maar ook over meerdere lagen. Het is het product van een recent project met een antropoloog, een wiskundige, een natuurkundige, en een computerwetenschapper.
SFI Omidyar Fellow Eleanor Power, de antropoloog, zegt dat het model breed toepasbaar is op verschillende netwerktypes. "Het kan ook ontbrekende informatie voorspellen, " zegt SFI Postdoctoraal Fellow Caterina De Bacco, de fysicus van de groep.
Power en De Bacco werkten samen met SFI Omidyar Fellow Daniel B. Larremore, een wiskundige, en SFI-professor Cristopher Moore, een computerwetenschapper en polymath. De groep publiceerde hun werk op 24 april in het tijdschrift Fysieke beoordeling E .
Ze testten het model op twee datasets. De eerste kwam van Power, die twee jaar besteedde aan het verzamelen van gegevens op sociale netwerken in twee dorpen op het platteland van India. In haar werk, lagen corresponderen met relaties zoals vrienden, babysitters, of mensen die elkaar geld zouden lenen. Het model voorspelde met succes ontbrekende verbindingen in haar data, zowel binnen als tussen lagen.
De onderzoekers analyseerden vervolgens de genetische gegevens van Larremore over de malariaparasiet, waarin de links van het netwerk overeenkomen met gedeelde genetische substrings en lagen vertegenwoordigen verschillende locaties binnen het parasietgenoom. In dat geval, de voorspellende kracht van het model verslechterde met meer lagen - waarschijnlijk omdat parasieten met meer genetische diversiteit het immuunsysteem van een gastheer beter kunnen ontwijken.
De Bacco zegt dat de medewerkers het model hebben gebouwd om breed toepasbaar te zijn op onderzoekers - in de natuurkunde en andere gebieden - en de code hebben vrijgegeven. in een gebruiksvriendelijk formaat, voor iedereen die het wil.
Wetenschap © https://nl.scienceaq.com