De intermoleculaire kracht die in waterstofsulfide wordt aangetroffen, is waterstofbinding. Waterstofbinding is een soort dipool-dipoolinteractie die optreedt wanneer een waterstofatoom is gebonden aan een zeer elektronegatief atoom, zoals zuurstof, stikstof of fluor. In het geval van waterstofsulfide is het waterstofatoom gebonden aan een zwavelatoom, dat elektronegatief genoeg is om een ​​gedeeltelijke positieve lading op het waterstofatoom te creëren. Deze gedeeltelijke positieve lading interageert vervolgens met de gedeeltelijke negatieve lading op het zwavelatoom van een ander waterstofsulfidemolecuul, waardoor een waterstofbrug ontstaat.