Er is een verrassende hoeveelheid informatie opgeslagen in de verharde plaque, of rekenen, tussen de tanden. En als die calculus behoort tot de overblijfselen van een persoon die in de oudheid leefde, de informatie zou nieuwe inzichten over het verleden kunnen onthullen. Maar de kleine monsters kunnen moeilijk zijn om mee te werken. Nutsvoorzieningen, in ACS' Journal of Proteome Research , wetenschappers passen een nieuwe methode toe op deze analyse, het vinden van meer eiwitten dan traditionele benaderingen.

De menselijke mond zit vol met interessante moleculen:DNA en enzymen in speeksel, eiwitten en lipiden van stukjes voedsel tussen de tanden, de bacteriële burgers van het orale microbioom. Onder de juiste omstandigheden, die moleculen kunnen duizenden jaren in tandsteen worden bewaard. Het identificeren van de biomoleculen die zijn bewaard in oude plaques, geeft onderzoekers aanwijzingen over hoe onze voorouders leefden, wat ze aten, welke ziekten ze hadden en meer. Echter, er is maar zoveel tandplak dat je van oude tanden kan schrapen, het is dus belangrijk om methoden toe te passen die de meeste informatie uit minuscule monsters kunnen halen. Hoewel er geen gouden standaardmethode voor calculusanalyse bestaat, filtergebaseerde technieken worden vaak gebruikt, maar ze kunnen tijdrovend zijn en kunnen verontreinigingen introduceren. Dus, teams onder leiding van Michael Buckley en Cheryl Makarewicz wilden zien of een andere methode, genaamd single-pot, vaste fase verbeterde monstervoorbereiding (SP3), zou het aantal en de complexiteit van eiwitfragmenten kunnen verbeteren die kunnen worden geanalyseerd uit geconserveerde plaque.

De onderzoekers, onder leiding van Karren Palmer, SP3 toegepast op de analyse van calculus van 153 oude individuen die dateren tussen de 1 ^NS en 4 ^e eeuw voor Christus. Met SP3, gefunctionaliseerde magnetische kralen grepen op eiwitfragmenten, waardoor ze gemakkelijk te analyseren zijn met massaspectrometrie. De onderzoekers ontdekten dat SP3 op betrouwbare wijze het aantal unieke eiwitfragmenten verhoogde dat ze in monsters konden identificeren, inclusief kleinere peptiden dan twee andere methoden, ultrafiltratie en acetonprecipitatie, gemist. SP3 was ook gemakkelijk uit te voeren en had minder kans om verontreinigingen te introduceren dan de andere methoden. Met behulp van deze aanpak, de onderzoekers identificeerden fragmenten van zuiveleiwitten uit de voeding van de proefpersonen, evenals bacteriële eiwitten die licht kunnen werpen op oude ziekten.