Wetenschap
Een verbeterde methode voor visualisatie van eiwitkristalstructuur. Krediet:Immanuel Kant Baltische Federale Universiteit
De visualisatietechniek van röntgenkristallen is al meer dan honderd jaar bekend. Terwijl het steeds beter wordt, het is buitengewoon moeilijk om stralen te focussen op objecten die onzichtbaar zijn voor het blote oog, zoals eiwitten. Echter, om een duidelijk beeld te krijgen en de structuur van een kristal effectief te visualiseren, een monster moet correct worden geplaatst. Een internationaal team van wetenschappers stelde een optisch systeem voor om een eiwitkristal in röntgenstralen te helpen zien en in het midden van een straal te plaatsen. De resultaten van het onderzoek zijn gepubliceerd in de structurele biologie logboek.
Tijdens kristallisatie worden atomen gerangschikt in een 3D-rooster dat op een specifieke manier is gestructureerd. De afstanden tussen de atomen in dat rooster worden bepaald door de atomen zelf. De röntgengolflengte is vergelijkbaar met interatomaire afstanden, zodat de stralen op de vlakken kunnen worden gebroken. Door dit effect kan men kristalstructuur analyseren. De röntgenfoto's tonen de afstanden tussen de vlakken. Op basis van deze informatie is het mogelijk om te bepalen welke atomen zich in het rooster bevinden en hoe ze met elkaar omgaan. In eiwitonderzoeken bijvoorbeeld bij het zoeken naar nieuwe medicijnen, hun structuur kan worden bepaald op het niveau van basisatomaire groepen (aminozuren).
Het belangrijkste probleem van röntgenkristallografie is dat microscopisch kleine eiwitkristallen erg moeilijk te positioneren zijn in het midden van een röntgenstraal, en daarom kan dat röntgendiffractiebeeld wazig zijn. Bovendien, als de exacte positie van een kristal onbekend is, men moet het hele monster scannen. Dit verlengt de tijd van blootstelling aan zeer intensieve röntgenstraling. Biologische moleculen beginnen bij die blootstelling te denatureren.
Een internationaal team van wetenschappers ontwikkelde een optisch systeem waarmee men een monster in röntgenstralen kan zien en zijn positie en oriëntatie ten opzichte van de straal kan onderscheiden. Net als bij een gewone optische microscoop kan hij het monster verplaatsen, de straalintensiteit aanpassen, en focus de straal. Een dergelijk systeem kan de analysetijd aanzienlijk verkorten en zo de integriteit van de moleculen behouden. Wetenschappers hebben aangetoond hoe het systeem werkt aan het voorbeeld van een kristal van het antibacteriële eiwit lysozym. De kwaliteit van röntgendiffractiebeelden bleek veel hoger te zijn na positionering van het monster in de röntgenbundel.
"Ons systeem wordt nu met succes gebruikt in het internationale onderzoekscentrum door de DESY-synchrotron in Hamburg, waar de laboratoria van 's werelds toonaangevende universiteiten hun kristalstructuurstudies uitvoeren. In de toekomst, we zijn van plan het kristalpositioneringsproces te automatiseren met behulp van neurale netwerken, " zei prof. Anatoly Snigirev, het hoofd van het Wetenschaps- en Onderzoekscentrum "Coherent X-Ray Optics for Megascience Installations, " aan de Kant Baltic Federal University.
Chemische doorbraken openen nieuwe deuren voor medicijnontwikkelaars en kankeronderzoekers
Nul tot held:over het hoofd gezien materiaal kan onze ecologische voetafdruk helpen verkleinen
Hoe reinigt wasmiddel oppervlaktespanning?
Nieuwe legering kan het gewicht van warmteafvoersystemen direct met een derde verminderen
Nieuwe katalysator zet broeikasgassen om in waterstofgas
Het verschil tussen Meerval & Tilapia
Parijs zet zich schrap voor recordhitte terwijl Europa opnieuw verschroeide
Luchtvervuiling door fijne deeltjes is in de VS afgenomen, maar arme en minderheidsgemeenschappen zijn nog steeds het meest vervuild
Duitsland belooft het overstromingswaarschuwingssysteem te verbeteren als de tol de 165 passeert
Klimaatverandering hielp orkaan Ida te intensiveren:een mogelijke preview van wat komen gaat
Maak kennis met Cheddar Man:Your New Stone Age Crush
Hoe rupsen van nanodeeltjes te beschermen tegen de kraaien van het immuunsysteem?
PizzaGAN krijgt de foto over hoe je een pizza maakt
De aarde heeft meerdere methoden nodig om CO2 uit de lucht te verwijderen om de ergste klimaatverandering af te wenden
Canadese kariboes, habitat blijft afnemen:rapport
NASA ziet grote orkaan Kenneth in de oostelijke Stille Oceaan
Wat als ik droogijs aanraak?
Ingenieurs ontwikkelen techniek om adaptieve materialen te maken
Wetenschap © https://nl.scienceaq.com