Wetenschap
Krediet:American Chemical Society
Het snoepje, zetmeelrijke oranje zoete aardappelen zijn smakelijke en voedzame ingrediënten voor friet, ovenschotels en taarten. Hoewel mensen al duizenden jaren zoete aardappelen telen, wetenschappers weten nog steeds niet veel over de eiwitsamenstelling van deze knollen. in ACS' Journal of Proteome Research , onderzoekers hebben het proteoom van zoete aardappelbladeren en -wortels geanalyseerd, en in het proces, hebben nieuwe inzichten in het genoom van de plant onthuld.
De zoete aardappel ( Ipomoea batatas , Lam.) is een hoofdvoedsel in sommige delen van de wereld, naast dat het wordt gebruikt voor diervoeder en industriële producten, zoals biobrandstoffen. De plant heeft een verrassend complex genoom, coderen voor meer voorspelde genen dan het menselijk genoom. Zoete aardappel heeft ook een complexe chemische samenstelling, met een laag eiwitgehalte in de wortels (het deel dat mensen eten) en veel secundaire metabolieten in de bladeren, waardoor het moeilijk is om voldoende hoeveelheden eiwitten voor analyse te extraheren. Sorina en George Popescu en collega's wilden zien of een 'proteogenomics'-benadering - door zowel eiwit- als genetische gegevens samen te analyseren - hen zou kunnen helpen een beter begrip te krijgen van de samenstelling van wortels en bladeren van zoete aardappelen.
Het team extraheerde eiwitten uit wortel- en bladmonsters met behulp van twee verschillende methoden en sneed ze in peptiden, die ze analyseerden met vloeistofchromatografie en massaspectrometrie. De onderzoekers identificeerden 3, 143 unieke eiwitten uit zoete aardappelbladeren en 2, 928 van wortels. Toen ze de proteomische gegevens vergeleken met het genoom van de zoete aardappel, ze identificeerden enkele regio's in de gepubliceerde genoomsequentie waar hun gegevens verbeterde informatie zouden kunnen bieden. Bijvoorbeeld, de analyse voorspelde 741 nieuwe eiwitcoderende regio's waarvan eerder niet werd gedacht dat het genen waren. De groep zegt dat de resultaten kunnen worden gebruikt om de knol verder te karakteriseren en te versterken.
Wetenschap © https://nl.scienceaq.com