* Nucleus: Dit is de primaire locatie van DNA in eukaryotische cellen. Het herbergt het grootste deel van het genetische materiaal van de cel in de vorm van chromosomen.

* mitochondria: Deze organellen hebben hun eigen DNA, genaamd mitochondriaal DNA (mtDNA). MtDNA is een cirkelvormig molecuul gescheiden van het nucleaire DNA en codeert voor sommige van de eiwitten die betrokken zijn bij de mitochondriale functie.

* chloroplasten (in plantencellen): Deze organellen, verantwoordelijk voor fotosynthese, hebben ook hun eigen DNA genaamd chloroplast DNA (cpDNA). Net als mtDNA is cpDNA circulair en codeert voor sommige eiwitten die betrokken zijn bij de chloroplastfunctie.

Het is belangrijk op te merken dat hoewel deze organellen DNA bevatten, dit niet de hele genetische blauwdruk van de cel is. De kern bevat de overgrote meerderheid van de genetische informatie voor de cel.