* Gramkleuring is gebaseerd op verschillen in celwandstructuur. Bacteriën hebben een dikke peptidoglycan -laag in hun celwanden, die de kristalviolette vlek vangt. Hierdoor lijken ze paars onder de microscoop.

* menselijke cellen missen deze dikke peptidoglycan -laag. In plaats daarvan hebben ze een celmembraan en een meer complexe structuur genaamd het plasmamembraan. Met deze structuur kan de kristalviolette vlek gemakkelijk wegspoelen tijdens de ontkleuringsstap.

* gram-negatieve bacteriën missen ook een dikke peptidoglycan-laag. Ze hebben echter een buitenmembraan dat voorkomt dat de kristalviolette vlek volledig wordt weggespoeld. Dit geeft hen een roze uiterlijk onder de microscoop.

Daarom lijken menselijke cellen kleurloos na de gram kleurprocedure.

Belangrijke opmerking: De Gram -vlek wordt voornamelijk gebruikt om onderscheid te maken tussen bacteriesoorten, niet om menselijke cellen te identificeren.