Hij deed dit via zijn beroemde Swan-Neck Flese-experiment. Hier is de kern:

* Pasteur gekookte rundvleesbouillon in zwanenhalskolfen , die een lange, gebogen nek had waardoor lucht binnen kon komen maar voorkwam dat stof en micro -organismen de bouillon bereikten.

* De bouillon bleef lange tijd steriel , zelfs wanneer blootgesteld aan lucht.

* Toen hij de nek van de kolf brak , waarbij de bouillon rechtstreeks aan de lucht werd blootgesteld, groeiden micro -organismen binnen enkele dagen in de bouillon.

Dit experiment bewees dat micro -organismen in de lucht, niet spontane generatie, verantwoordelijk waren voor de groei van organismen in de bouillon. Het hielp de theorie van spontane generatie definitief te weerleggen, die al eeuwen algemeen was aanvaard.