* Het specifieke aangetaste gen: Mutaties in genen die fundamentele cellulaire processen, ontwikkeling of immuunfunctie beheersen, hebben waarschijnlijk een grotere impact dan die in genen met minder kritieke rollen.

* De aard van de mutatie: Sommige mutaties zijn stil (geen effect op de eiwitfunctie), anderen zijn missense (wijzig het aminozuur) en anderen zijn onzin (creëer een voortijdig stopcodon). Onzin en missense -mutaties hebben meer kans op significante effecten.

* De omgeving: Een nuttige mutatie in de ene omgeving kan in de andere schadelijk zijn. Een mutatie die een organisme in een warm klimaat kan gedijen, kan bijvoorbeeld schadelijk zijn in een koud klimaat.

* Populatiegrootte en genetische drift: In kleine populaties kan zelfs een enigszins nuttige mutatie zich snel verspreiden vanwege genetische drift.

We kunnen echter generaliseren en zeggen dat bepaalde soorten mutaties eerder aanzienlijke evolutionaire gevolgen hebben:

* mutaties die de regulerende regio's beïnvloeden: Deze regio's beheersen genexpressie, en zelfs kleine veranderingen kunnen een grote impact hebben op het fenotype van een organisme.

* mutaties die veranderingen in eiwitfunctie veroorzaken: Deze kunnen cruciale cellulaire processen verstoren en leiden tot significante veranderingen in de fysiologie van een organisme.

* Deleterious mutaties: Deze mutaties kunnen schadelijk zijn en leiden tot een afname van fitness, waardoor de natuurlijke selectie mogelijk wordt gestimuleerd.

* nuttige mutaties: Deze mutaties kunnen de conditie van een organisme verbeteren en de kansen op overleving en reproductie vergroten, wat mogelijk leidt tot de evolutie van nieuwe eigenschappen.

Uiteindelijk wordt het evolutionaire gevolg van een mutatie bepaald door een complex samenspel van factoren. De belangrijkste mutaties zijn die die de fitness van het organisme veranderen, waardoor het min of meer geneigd is te overleven en zich voort te planten in zijn omgeving. Dit kan leiden tot veranderingen in de frequentie van genen binnen een populatie en uiteindelijk de evolutie van nieuwe soorten.