Hij ontdekte dat de hoeveelheid adenine (A) in DNA altijd gelijk is aan de hoeveelheid thymine (T), en de hoeveelheid cytosine (C) is altijd gelijk aan de hoeveelheid guanine (G). Deze ontdekking, bekend als de regels van Chargaff, was cruciaal voor het begrijpen van de structuur van DNA.