Het is echter belangrijk op te merken dat de classificatie van het leven in vijf koninkrijken (Animalia, Plantae, Fungi, Protista en Monera) een ouder systeem is. Moderne classificatie maakt gebruik van een drieledig systeem:

* bacteriën: Bevat alle echte bacteriën.

* archaea: Inclusief extremofielen en andere unieke prokaryoten.

* eukarya: Bevat alle organismen met eukaryotische cellen (planten, dieren, schimmels en protisten).

Dus terwijl Monera vroeger het koninkrijk was voor prokaryoten, plaatst de huidige, meer accurate classificatie prokaryoten in de bacteriën en archaea Domeinen.