1. Obligate aeroben: Deze microben vereisen zuurstof voor hun overleving en groei. Ze gebruiken zuurstof als de uiteindelijke elektronenacceptor in hun ademhalingsproces. Voorbeelden zijn:

* Mycobacterium tuberculosis (veroorzaakt tuberculose)

* pseudomonas aeruginosa (opportunistische ziekteverwekker)

* Bacillus subtilis (gebruikt bij voedselproductie)

2. Obligate anaëroben: Deze microben kunnen niet overleven in aanwezigheid van zuurstof. Zuurstof is giftig voor hen en ze kunnen zelfs sterven als ze eraan worden blootgesteld. Ze verkrijgen energie door anaërobe ademhaling of gisting. Voorbeelden zijn:

* Clostridium Botulinum (veroorzaakt botulisme)

* bacteroides fragilis (Gemeenschappelijke darmbacteriën)

* methanogenen (produceren methaan)

3. Facultatieve anaerobes: Deze microben kunnen overleven met of zonder zuurstof . Ze geven de voorkeur aan zuurstof voor ademhaling, maar kunnen overschakelen naar anaërobe ademhaling of gisting als zuurstof niet beschikbaar is. Voorbeelden zijn:

* Escherichia coli (Gemeenschappelijke darmbacteriën)

* Staphylococcus aureus (opportunistische ziekteverwekker)

* Saccharomyces cerevisiae (gist gebruikt bij het brouwen en bakken)

4. Aerotolerante anaëroben: Deze microben verdragen zuurstof Maar gebruik het niet voor ademhaling. Ze verkrijgen energie door anaërobe ademhaling of gisting. Voorbeelden zijn:

* lactobacillus (gebruikt in yoghurt en ander gefermenteerd voedsel)

* Streptococcus pyogenes (veroorzaakt keelpijn)

* Clostridium perfringens (veroorzaakt gas gangreen)

5. Microaerofielen: Deze microben vereisen lage zuurstofniveaus voor groei. Hoge zuurstofconcentraties zijn giftig voor hen. Voorbeelden zijn:

* Campylobacter Jejuni (veroorzaakt voedselvergiftiging)

* Helicobacter Pylori (veroorzaakt maagzweren)

* Neisseria gonorrhoeae (veroorzaakt gonorroe)

Het is belangrijk op te merken dat deze classificatie is gebaseerd op de optimale Zuurstofconcentratie voor groei. Microben kunnen mogelijk overleven in andere zuurstofconcentraties, maar ze zullen niet ook groeien. Het begrijpen van deze zuurstofvoorkeuren is cruciaal voor het kweken en bestuderen van microben in het laboratorium en voor het beheersen van hun groei in verschillende toepassingen.