* monofletisch: Een monofletische groep omvat een voorouder en al zijn nakomelingen.

* Parafyletisch: Een parafyletische groep omvat een voorouder en sommige, maar niet alle, van zijn nakomelingen.

Prokaryoten zijn een parafyletische groep omdat ze de gemeenschappelijke voorouder van al het leven omvatten, maar ze sluiten de nakomelingen uit die zijn geëvolueerd naar eukaryoten .

Hier is een uitsplitsing:

1. Vroege leven: De eerste levensvormen op aarde waren prokaryoten.

2. evolutie van eukaryoten: Eukaryoten evolueerden uit prokaryoten, met name door een proces dat endosymbiose wordt genoemd.

3. Diversiteit van prokaryote: Na de divergentie van eukaryoten bleven prokaryoten diversifiëren in bacteriën en archaea.

Omdat eukaryoten afstammelingen zijn van dezelfde voorouder als bacteriën en archaea, is de groep "prokaryoten" niet monofyletisch omdat het eukaryoten uitsluit.

Daarom is het niet juist om te zeggen dat prokaryoten niet monofyletisch zijn. In plaats daarvan worden ze beschouwd als een parafyletische groep.