Hoewel niet de eerste die dit idee voorstelt, leverde Pasteur's beroemde Swan-neck Flask-experiment in de jaren 1860 sterk bewijs op tegen de heersende theorie van spontane generatie en heeft definitief aangetoond dat bacteriën afkomstig zijn van bestaande bacteriën, niet van niet-levende materie.

Zijn werk was cruciaal bij het vaststellen van de kiemtheorie van ziekten en een revolutie teweegbrengen in ons begrip van microbiologie.