1. Sugar: RNA bevat ribose Suiker, terwijl DNA deoxyribose bevat suiker. Het verschil ligt in aanwezigheid van een hydroxylgroep (-OH) op de 2 'koolstof van ribose, die afwezig is in deoxyribose. Dit maakt RNA minder stabiel dan DNA, omdat de hydroxylgroep reactiever is.

2. stikstofbases: Zowel RNA als DNA gebruiken adenine (A), guanine (G) en cytosine (C), maar RNA gebruikt uracil (u) in plaats van thymine (t) , die wordt gevonden in DNA. Uracil paren, net als thymine, met adenine.