1. Celwandsamenstelling:

* bacteriën: Heb peptidoglycan in hun celwanden, een uniek polymeer dat niet wordt gevonden in andere organismen.

* archaea: Ontbreekt peptidoglycan en hebben verschillende celwandsamenstellingen, vaak met pseudopeptidoglycan, eiwitten of S-laag.

2. Membraanstructuur:

* bacteriën: Hebben vetzuren gekoppeld aan glycerol door esterbindingen in hun celmembranen.

* archaea: Hebben vertakte koolwaterstoffen gekoppeld aan glycerol door etherbindingen in hun celmembranen. Deze structuur biedt een verhoogde stabiliteit in extreme omgevingen.

3. Genstructuur en expressie:

* bacteriën: Genen zijn georganiseerd in operonen, waarbij meerdere genen worden getranscribeerd als een enkel mRNA -molecuul.

* archaea: Hebben genorganisatie meer vergelijkbaar met eukaryoten, met afzonderlijke genen afzonderlijk getranscribeerd.

4. Metabole paden:

* archaea: Vertonen diverse metabole routes, inclusief unieke, zoals methanogenese (producerende methaan) die niet in bacteriën worden gevonden.

* bacteriën: Heb een breder scala aan metabole paden in het algemeen, maar missen enkele unieke paden die in Archaea worden gevonden.

5. Genetische machines:

* archaea: Heb een unieke set transcriptie- en vertaalmachines die meer op eukaryoten lijkt dan bacteriën.

6. Evolutionaire geschiedenis:

* archaea: Onafhankelijk van bacteriën geëvolueerd en een gemeenschappelijke voorouder delen met eukaryoten.

* bacteriën: Onafhankelijk geëvolueerd van Archaea en Eukaryotes.

7. Habitat:

* archaea: Bekend om bloeien in extreme omgevingen zoals warmwaterbronnen, zoutmeren en diepzeeopeningen, zijn vaak extremofielen.

* bacteriën: Gevonden in een breder scala aan habitats, waaronder bodem, water en het menselijk lichaam.

Samenvattend: Hoewel archaea en bacteriën beide prokaryoten zijn (zonder een kern), hebben ze significante verschillen in hun biochemie, genetica en evolutionaire geschiedenis, die hun classificatie als afzonderlijke domeinen rechtvaardigen. Dit onderscheid weerspiegelt de enorme diversiteit en complexiteit van het leven op aarde.