Eencellige organismen, zoals bacteriën en amoeba, reproduceren aseksueel, voornamelijk door een proces dat binaire splijting wordt genoemd. Dit betekent dat ze zich opsplitsen in twee identieke kopieën van zichzelf. Daarom is in de meeste gevallen een eencellig organisme genetisch identiek aan zijn ouder .

Er zijn echter een paar manieren waarop verschillen kunnen ontstaan:

* mutaties: Hoewel zeldzaam, kunnen mutaties optreden tijdens DNA -replicatie. Deze veranderingen in de DNA -sequentie kunnen leiden tot verschillen tussen de ouder en de nakomelingen.

* Omgevingsfactoren: Sommige eencellige organismen kunnen zich aanpassen aan hun omgeving door veranderingen in genexpressie. Dit betekent dat ze kunnen veranderen hoe hun genen worden gebruikt, wat leidt tot functionele verschillen van hun ouder. Deze veranderingen zijn niet geërfd, maar komen binnen het leven van het individu voor.

* Horizontale genoverdracht: Dit proces, gebruikelijk in bacteriën, omvat de overdracht van genetisch materiaal rechtstreeks van het ene organisme naar het andere, niet alleen door ouder naar nakomelingen. Dit kan nieuwe genen en eigenschappen in de nakomelingen introduceren die de ouder niet bezat.

Over het algemeen zijn verschillen tussen eencellige organismen en hun ouders relatief zeldzaam , en komen vaak voor door willekeurige mutaties of omgevingsinvloeden. Hoewel deze verschillen significant kunnen zijn, zijn ze over het algemeen niet zo uitgesproken als de verschillen die worden gezien in nakomelingen die worden geproduceerd door seksuele reproductie in meercellige organismen.