SeaWorld moet zeedieren naar zijn parken vervoeren om verschillende redenen, variërend van fokken tot het redden van dieren uit andere parken die hun deuren sluiten. Omdat deze dieren enkele duizenden ponden kunnen wegen, heeft SeaWorld een proces en de transporttechnologie ontwikkeld. De ontdekking dat Sea World dieren sedert die naar een ander park zullen worden gebracht, heeft geschreeuw van dierenverdedigers aangewakkerd.
Aangepaste tanks

SeaWorld creëert op maat gemaakte open tanks om de dieren van de ene naar de andere locatie te brengen. De grootte van de container is afhankelijk van de grootte van het dier en is opgevuld met schuim. SeaWorld gebruikt een vorkheftruck en een slinger om het dier in de tank te laten zakken, die meestal wordt gevuld met duizenden liters water en vervolgens op een dieplader wordt geplaatst. Toen de orka Shouka in 2012 vanuit het Six Flags Discovery Kingdom in Vallejo, Californië, naar SeaWorld San Diego werd vervoerd, woog de container volgens NBC 38.000 pond.
Reizen en bezoekers

SeaWorld gebruikt gecharterd jets, zoals een C130 vrachtvliegtuig of Federal Express Jumbo Jet, om een dier en tank naar de gewenste locatie te vliegen. Een team bestaande uit trainers, begeleiders en dierenartsen begeleidt het dier tijdens de reis. Dit team houdt toezicht op de temperatuur, druk en omstandigheden van de binnenkant van de jet. In de lucht gieten bedienden regelmatig water over het dier. Toen de orka Baby Shamu in 1990 vanuit Orlando, Florida, naar Ohio werd getransporteerd, goten vier aanwezigen water over de walvis tijdens een vlucht van twee uur, volgens de Orlando Sentinel
De planning

Planning van de het transport van Baby Shamu, de eerste orka geboren in gevangenschap, duurde zes maanden, vertelden ambtenaren van SeaWorld de Orlando Sentinel. Om de walvis over staatslijnen te laten vliegen, moest SeaWorld een transportvergunning aanvragen bij de deelstaatregering van Florida. Volgens de wet van Florida hoeven overheidsfunctionarissen geen rekening te houden met het sociale of familiale netwerk van een dier voordat ze de vergunning verlenen. Voorstanders van dieren beweren dat SeaWorld de sterke familiebanden negeert die door orka's worden gevormd. Ze geloven dat het pendelen van dieren van park naar park stress voor het dier veroorzaakt en de emotionele en fysieke gezondheid van het dier bedreigt.
Gebruik van medicijnen

In een geschil tussen SeaWorld en Marineland over de bewaring en het transport van de orka Ikaika, blijkt uit gerechtelijke documenten dat SeaWorld-trainers benzodiazepine gebruikten - een middel tegen angst volgens Valium en Xanax - om het dier te verdoven, volgens de San Antonio Express-News. Het medicijn voorkomt dat de orka's agressief optreden in besloten gebieden. Het kalmeert ook de walvissen zodat SeaWorld-trainers de walvissen gemakkelijker van elkaar kunnen scheiden en voorbereiden op transport. Hoewel ambtenaren van SeaWorld beweren dat het gebruik van dit psychotrope medicijn wordt gereguleerd en toegediend door een dierenarts, vinden dierenverdedigers de praktijk onmenselijk.