science >> Wetenschap >  >> Fysica

Holografische fluorescentiebeeldvorming om extracellulaire blaasjes in 3D te volgen

Experimentele implementatie van single-shot fluorescentieholografie. Fluorescentie shearing holografie-opstelling verkregen door een fluorescentie-breedveldmicroscoop uit te breiden met een golffrontsensor bestaande uit een 2D 0-π faserooster en een relaisbeeldvormingssysteem gemonteerd op de uitgangspoort van de microscoop. Het harde diafragma blokkeert alles behalve de eerste diffractieorders. Krediet:wetenschappelijke vooruitgang, doi:10.1126/sciadv.abc2508

Biologen gebruiken vaak fluorescentiemicroscopie vanwege de moleculaire specificiteit en superresolutie van de techniek. Echter, de methode wordt tegengehouden door beeldvormingslimieten. In een nieuw verslag over wetenschappelijke vooruitgang , Matz Liebel en een onderzoeksteam van het Barcelona Institute of Science and Technology en het Massachusetts General Hospital in Spanje en de VS rapporteerden een beeldvormende benadering om het volledige elektrische veld van fluorescerend licht te herstellen met behulp van de gevoeligheid van één molecuul. Het team experimenteerde met het concept van digitale holografie voor snelle fluorescentiedetectie door het driedimensionale (3-D) traject van individuele nanodeeltjes te volgen met een resolutie van 15 nanometer in het vlak. Als proof-of-concept biologische toepassingen, de onderzoekers beeldden de 3D-beweging van extracellulaire blaasjes in levende cellen af.

Nano-afgifte in levend weefsel

In dit werk, Liebel et al. ontwikkelde op fluorescentieholografie gebaseerde 3D-deeltjeslokalisatie over extracellulaire blaasjes in levende cellen en observeerde sterk opgesloten blaasjes met perioden van actief transport. Het leveren van vrachtvervoer in vivo is momenteel een grote uitdaging, om actief minimaal invasieve nanogeneeskundeplatforms te implementeren. Nanodeeltjes (NP's) en extracellulaire voertuigen kunnen worden ontworpen als veelbelovende kandidaten om als voertuigen te leveren, maar wetenschappers begrijpen de precieze reis van dergelijke apparaten in levend weefsel nog niet.

Om deze uitdagingen te overwinnen, ze moeten wide-field driedimensionale (3-D) single-particle imaging-methoden ontwikkelen om individuele deeltjes tegelijkertijd te volgen terwijl ze naar hun beoogde bestemming reizen. Onderzoeksteams hadden eerder holografische benaderingen van microscopie geïmplementeerd, hoewel de incoherentie van fluorescerend licht niet goed geschikt is voor levende cellen of beeldvorming met één molecuul. In vergelijking, shearing interferometrie is een veelbelovende methode om enkelvoudige opname van dynamische processen te realiseren. Het onderliggende idee achter afschuifinterferometrie omvat zelfinterferentie om toegang te krijgen tot fasegradiënten tot op een enkel fotonniveau om single shot fluorescentieholografie te bereiken. De mechanismen die in dit werk zijn ontwikkeld, dienen daarom om intracellulaire translocatie over micrometer-lengteschalen te observeren om biologen een dieper inzicht te geven in intracellulaire mechanismen.

Workflow voor elektrische veldreconstructie. (A) Experimenteel verkregen beeld van onscherpe 200 nm fluorescerende kralen die door shearing geïnduceerde ruimtelijke modulatie van de puntspreidingsfuncties (PSF's) laten zien. (B) Fast Fourier-transformatie (FFT) van (A) maakt isolatie van de interferentietermen van belang in zowel de x- als de y-dimensie mogelijk door middel van harde diafragma-isolatie en verschuiving naar nulfrequentie. (C) Inverse snelle Fourier-transformatie (iFFT) van de termen geïsoleerd uit (B) levert de gewenste fasegradiënten op. (D) Analytische 2D-integratie met een Poisson-oplosser levert het beeld van de onbewerkte fase op. (E) Faseschaal, om rekening te houden met de afstand tussen het rooster en de camerachip, gevolgd door aberratiecorrectie resulteert in de laatste fase- en amplitudebeelden. Alle schaalbalken zijn identiek, en de 0-2π-fasewikkeling is alleen voor visualisatiedoeleinden; de onverpakte informatie wordt direct verkregen. Krediet:wetenschappelijke vooruitgang, doi:10.1126/sciadv.abc2508

Beeldvormingsprincipe en systeemvalidatie voor het volgen van 3D-deeltjes

Het team gebruikte een wide-field fluorescentiemicroscoop met een wavefront shearing-sensor bestaande uit een relay-beeldvormingssysteem. De geometrie van de opstelling zorgde ervoor dat fasegradiënten die niet nul waren werden gemeten en Liebel et al. om zelfinterferentie met één foton uit te voeren over een volledig beeld. Het team beeldde fluorescerende polystyreenkralen af ​​als onscherpe 200 nm-deeltjes en haalde de intensiteitsinformatie eruit als argumentmodulus van de gefilterde afbeeldingen voor fasegradiëntextractie. Na het observeren van het volledige elektrische veld, ze gebruikten Fourier-optica om complexe door verstrooiing veroorzaakte aberraties te corrigeren of afbeeldingen te construeren op elk gewenst vlak. Het team concentreerde zich op 3D-lokalisatie-experimenten die het herstel van de precieze positie van een van belang zijnde emitter over alle dimensies vereisten, inclusief het Z-vlak. Computational focusinspanningen wezen op het precieze vermogen om de 3D-positie van meerdere vrij verspreidende fluorescerende deeltjes te bepalen.

Het computationele focusseringstraject testen

Proof-of-concept experimenten. (A) Een fluorescerende kraal van 200 nm die 4,4 m boven de focus (boven) is opgenomen, wordt computationeel opnieuw gefocust (onder). De inzet toont een experimenteel verkregen in-focus beeld van hetzelfde deeltje naast een snede door de respectieve PSF's (wit gestreept:in-focus; roze, solide:opnieuw gefocust). (B) Gelijktijdige 3D-tracking van drie fluorescerende kralen van 200 nm door het monster met een piëzo-podium langs een bekend traject te verplaatsen (roze:piëzo-beweging; blauw:gereconstrueerde trajecten van individuele kralen; zwart:gemiddelde traject). De individuele trajecten zijn voor de duidelijkheid in x/y over elkaar gelegd; z =0 m komt overeen met een deeltje dat in focus is. (C) Beoogde sub-diffractie-beperkte piëzo-trajecten (roze) vergeleken met een typisch beeld verkregen 900 nm boven de focus (links). De resulterende y/z en x/z gemiddelde trajectprojecties (zwart) komen goed overeen met het piëzotraject (roze), en blauwe stippen tonen alle posities die zijn verkregen door gelijktijdig 17 individuele fluorescerende kralen te volgen (rechts). Histogramgebaseerde analyse van de lokalisatieprecisie levert σx/σy =15 nm en σz =21,5 nm op, respectievelijk (noot S7). (D) Enkele ATTO647N-moleculen die onscherp zijn opgenomen (links) zijn met succes computationeel gefocust (midden). De representatieve gebieden van fluorescentie-emissie (roze, paars, en blauw) tonen eenstaps fotobleken zoals verwacht voor enkele emitters. (E) Photobleaching tijdsporen van de drie regio's gemarkeerd in (D); de stippellijn geeft het achtergrondniveau aan. Krediet:wetenschappelijke vooruitgang, doi:10.1126/sciadv.abc2508

Om computationele redenering achter de opstelling te testen, Liebel et al. genereerde een bekend 3D-traject en verplaatste een monster met geïmmobiliseerde fluorescerende kralen - terwijl beelden langs het pad werden opgenomen. Ze herstelden de fase- en amplitude-informatie en bepaalden de 3D-posities van individuele deeltjes met behulp van numerieke voortplanting. Om het toegankelijke Z-bereik te kwantificeren, ze hebben afzonderlijke deeltjes experimenteel onscherp gemaakt en vervolgens de afbeeldingen computationeel opnieuw gefocust om artefactvrije metingen te verkrijgen over een Z-bereik van ongeveer acht m. Het is belangrijk om te zorgen voor nauwkeurige lokalisatie op nanoschaal over schalen met een lengte van micrometers in 3D om diffunderende deeltjes op nanoschaal af te beelden. Fluorescentieholografie voldeed aan deze eisen. Als proof-of-concept, de wetenschappers beeldden het woord "holografie, " waarbij elke afzonderlijke invoerletter minder dan 50 nm breed was om een ​​goed opgeloste uitvoer te verkrijgen, bevestiging van de superresolutiecapaciteit van fluorescerende holografie.

Beeldvorming met één molecuul en de cellulaire opname van nanodeeltjes

Het team liet zien hoe fluorescentieholografie functioneerde onder biologisch belangrijke superresolutie-omstandigheden door een monster te meten dat was samengesteld uit individuele moleculen. Ondanks duidelijk verminderde fluorescentie-intensiteiten in de experimentele opstelling, het team behaalde computationele focus tot de diffractielimiet, zelfs voor fotonniveaus zo laag als 10 4 fotonen. Ze visualiseerden intracellulaire handel in anorganische nanodeeltjes en extracellulaire blaasjes met behulp van het systeem. Als modelsysteem ze gebruikten fluorescent gelabelde gouden nanostaafjes die inert zijn en daarom zonder interferentie met cellulaire functies om zich op te hopen in het cytoplasma, zoals geverifieerd met behulp van donkerveldbeelden van levende cellen. Het team volgde de banen van deeltjes door time-lapse-fluorescentiebeelden op te nemen en de fase- en amplitudetermen te extraheren. De sterk variërende puntspreidingsfuncties (PSF's) wezen op de aanwezigheid van nanostaafjes op verschillende Z-posities ten opzichte van het brandvlak.

3D fluorescentie tracking in levende cellen. (A) Typisch live-cel een-deeltje tracking experiment. (B) Verzadigde fluorescentiebeelden (roze) overlay op overeenkomstige helderveldbeelden van apenniercellen. (C) Fluorescentie-amplitude (links) en fase (rechts) verkregen door celmonster B af te beelden. Alle films worden opgenomen met een belichtingstijd van 100 ms over een totaal van 100 frames bij een beeldverwerkingscyclus van 1/20 om langdurige in beeld brengen. Om rekening te houden met de grote helderheidsverschillen tussen in-focus en out-of-focus deeltjes, we geven de genormaliseerde amplitude weer in plaats van de fluorescentie-intensiteit en hebben de schaal afgetopt op 0,5 met het maximum op 1. Insets:origineel, uitgepakt, fasebeelden die de convexe/concave kromming van deeltjes boven/onder het brandvlak van het beeld benadrukken. (D) vergelijkingen van originele amplitude-beeldsegmenten verkregen uit (C) met afbeeldingen die zijn verkregen door computationele voortplanting van −2 m (boven) en 2 m (onder). (E) 3D-trajecten verkregen door fluorescentieholografie voor deeltjes die in levende cellen diffunderen. Elk individueel traject heeft een individuele schaalbalk, en de z-positie is kleurgecodeerd. Krediet:wetenschappelijke vooruitgang, doi:10.1126/sciadv.abc2508

Het team voerde 3D-lokalisatie uit van elke individuele nanostaaf in de cel en reconstrueerde deeltjestrajecten over 100 observatiekaders om zes representatieve categorieën te verkrijgen, waar sommige deeltjes onbeweeglijk waren tijdens de observatietijd van 200 seconden, terwijl anderen vrij verspreid over meerdere micrometers. De resterende deeltjes vertoonden zowel gebonden als diffunderende toestanden. Op deze manier, de onderliggende fluorescentie-holografiemethode zou 3D-posities nauwkeurig kunnen bepalen.

Cellulaire opname en actief transport van extracellulaire blaasjes

Liebel et al. bestudeerde vervolgens het actieve 3D-transport van extracellulaire blaasjes (EV's) in levende cellen door HeLa-cellen te incuberen met fluorescerend gelabelde EV's. Ze verwierven elke vier seconden fluorescerende hologrammen om 3D-trajecten van individuele EV's te reconstrueren door een combinatie van geautomatiseerde en handmatige trajecten, het koppelen van de 3D EV-posities. Liebel et al. overlappende time-lapse-amplitudeprojecties van fluorescerende hologrammen met gelijktijdig opgenomen helderveldbeelden van individuele cellen, om te laten zien hoe de meeste EV's waren gelokaliseerd aan de rand van de hechtende cellen. De waarnemingen en berekeningen suggereerden dat de EV's vastzaten in een gebied, hun beweging beperken tot een bepaald volume; waarschijnlijk behorend tot het cellulaire cytoskelet.

Reconstructie van de 3D-trajecten van individuele extracellulaire blaasjes (EV's) in levende cellen. Krediet:wetenschappelijke vooruitgang, doi:10.1126/sciadv.abc2508

Outlook

Op deze manier, Matz Liebel en collega's bedachten een groot gezichtsveld single-shot fluorescentie holografie methode om 3D single-particle tracking over een Z-bereik van ongeveer acht micrometer mogelijk te maken. Om dit concept te bewijzen, het team implementeerde een eenvoudige experimentele opstelling met een geoptimaliseerde fotonendoorvoer. Dankzij de geoptimaliseerde functies was fluorescentieholografie een ideale benadering om het volgen van deeltjes in realtime te bestuderen. Het team toonde 3D-tracking van één deeltje en observeerde de beweging van objecten op nanoschaal in levende cellen, zoals fluorescent gelabelde gouden nanostaafjes en EV's (extracellulaire blaasjes). Terwijl gouden nanostaafjes alleen in het cytoplasma aggregeerden zonder internalisatie in de kern, de EV's verzamelden zich aan de randen van hechtende cellen in een verdringingseffect. Liebel et al. verwacht extra kleuring uit te voeren om het intracellulaire cytoskelet te identificeren, waardoor de intracellulaire architectuur wordt verbonden met de beweging van extracellulaire blaasjes. Deze inspanningen zullen licht werpen op de precieze mechanismen van vrachtvervoer en de internalisatie van deeltjes in cellen met belangrijke toepassingen in nanogeneeskunde om kritische vragen in biologie en geneeskunde te beantwoorden. Het mechanisme is even geschikt om andere volumetrische beeldvormingsmethoden uit te voeren om binnen weefsels te volgen en voor biochemische calciumbeeldvorming.

© 2020 Wetenschap X Netwerk