* Water: Het primaire bijproduct is waterdamp. Dit is een schone en milieuvriendelijke substantie.

* warmte: Brandstofcellen produceren ook wat warmte, die kunnen worden gebruikt voor verschillende doeleinden zoals verwarmingsgebouwen of het genereren van elektriciteit door gecombineerde warmte- en vermogenssystemen (CHP).

Belangrijke opmerking:

* De netheid van deze bijproducten hangt sterk af van de zuiverheid van de gebruikte waterstofbrandstof. Als de waterstof onzuiverheden zoals koolmonoxide of zwavel bevat, kan de brandstofcel kleine hoeveelheden andere bijproducten produceren, zoals koolstofdioxide of zwaveldioxide.

* Het gebruik van sterk gezuiverde waterstof uit hernieuwbare bronnen (zoals elektrolyse) kan echter deze onzuiverheden aanzienlijk minimaliseren en een vrijwel nulemissie-werking garanderen.

Over het algemeen worden waterstofbrandstofcellen beschouwd als een zeer efficiënte en schone energiebron met minimale omgevingsimpact.