* waterstof: Dit is de meest voorkomende brandstof voor brandstofcellen, omdat het alleen water produceert als bijproduct.

* methanol: Een vloeibare brandstof die gemakkelijker kan worden opgeslagen en getransporteerd dan waterstof.

* ethanol: Een andere vloeibare brandstof, die vaak wordt gebruikt in brandstofcellen voor voertuigen.

* Natural Gas: Kan worden gebruikt in brandstofcellen, maar vereist complexere verwerking.

Brandstofcellen gebruiken dus geen specifieke "energiebron" in de traditionele zin, maar gebruiken eerder verschillende brandstoffen om elektriciteit te genereren.